ゲノムシーケンス解析サービス

◎ゲノムシーケンス解析サービス◎
当社は2006年設立以来、個別化医療の推進を目指したマイクロアレイ技術によるゲノム解析サービスを進め、2020年以降は特に次世代シーケンス解析技術（NGS）によるヒト全ゲノム解析（WGS）を中⼼として早く精確になおかつ安価に読めるゲノムシーケンス解析サービスを強化し、多様な機種を揃え、WGS以外にもRNA-seq、全エクソーム解析（WES）など豊富なアプリケーションを展開してまいりました。

従来の変異解析や通常のトランスクリプトーム解析に加え、最近では組織切片内の転写産物を高い分解能で捉える空間トランスクリプトーム、NGSを用いたプロテオーム解析など幅広い応用のほか、ロングリードシーケンスによって従来の短鎖シーケンスでは解析できないゲノム領域や構造の解析も可能にするなど、当社では最先端の設備の導入を進め、幅広いユーザ様のニーズに柔軟にお応えできる体制を整えております。

ゲノムデータの取得のためのシーケンサープラットフォームとしてはIllumina社 NovaSeq X Plus、MGI社 DNBSEQ-T7およびDNBSEQ-G400、PacBio Revioなどの最先端プラットフォームを使用しており、ご要望に応じて機種をお選び頂けます。それぞれのシーケンサーの特性を活かし、統⼀性が重要な研究プロジェクト、⼤容量かつ高密度な疾患データの取得、あるいは安価かつ⼤規模なコホートデータ取得まで、多彩なニーズに対応可能です。ヒトWGSでは2025年8月までのべ3万検体近くの豊富な実績があります。さらに最近、植物、モデル動物、家畜などヒト以外の生物種に対してもゲノム解析を行なっております。サンプル数の大小にかかわらず、データ処理まで安心してご依頼いただくことが可能です。

ヒト以外の生物種における全ゲノム解析サービス、RNA-seqも開始いたしました。

弊社のゲノム解析サービスの特徴
早い：柔軟なスケジュール調整によりできる限り早期のデータ返却を目指します
精確：東北大学東北メディカル・メガバンク機構（ToMMo）のプロトコルに準じた作業工程を採用しています
安心：解析は全て国内のラボで行い、東北大学内のインターネットから隔離された環境でデータを取り扱います
実績：ヒト全ゲノム解析で3万検体以上の豊富な経験
安価：徹底したコスト削減によりお求めになりやすいシーケンスを実現します
柔軟：お客様のニーズに応じてフローセル占有・レーン占有・相乗りなど様々なスケールの解析および多様なアプリケーション・カスタムレシピ等に対応可能
便利：東北大学 東北メディカル・メガバンク機構の統合データベースdbTMM利用支援事業者に登録されていますので、当社の解析データの取得後、継続的な研究に便利

採用プラットフォーム
Illumina NovaSeq X Plus
MGI DNBSEQ-T7, DNBSEQ-G400
PacBio Revio

サービスの例
・短鎖シーケンス
　WGS/WES/RNA-seq
・ロングリードシーケンス
　WGS/ロングリードRNA-seq
・生物種はヒト/モデル生物/家畜その他に幅広く対応
・それぞれライブラリ作製・シーケンシング・2次解析（バリアントコール/トランスクリプトーム解析など）からお客様の必要に応じた解析プランをお選びいただけます。
・特殊なリード長やカスタムライブラリーのシーケンスなど特別なご要望がありましたらご相談に乗ります
・詳細については「解析のご依頼にあたって」 （ PDF / URL ） をご参照ください。

現在可能なアプリケーションは図1の色の濃い部分になっております。
その他アプリケーションについてはご相談下さい。

現在可能なアプリケーション（図1）

現在可能なアプリケーションの詳細説明
WGS解析: お客様のゲノムDNAを用いて、イルミナ社 もしくはMGI社 PCRフリーライブラリを調製し、重複リードを除く、検体あたり90Gb 以上のfastqデータをお届けします。DRAGENを用いた2次解析も別途有償にてお受けしております(アノテーション付きVCFファイル)。
RNAseq解析 (Poly-Aキャプチャー法): お客様のTotal RNAを用いて、イルミナ社 もしくはMGI社の転写の方向性情報付きライブラリを調製します。RIN値 7以上のTotal RNAから、mRNAのみを捕捉し検体あたり平均20Mリード以上をお届けします。
DRAGENを用いた2次解析は別途有償にてお受けします(遺伝子発現量カウント表)。
RNAseq解析 (rRNA除去法): お客様のTotal RNAを用いて、イルミナ社 もしくはMGI社の転写の方向性情報付きライブラリを調製します。
FFPE組織等のRNA分解のあるTotal RNAから遺伝子発現解析やpoly-Aを持たないnoncoding RNAの遺伝子発現解析が可能です。
真核生物のrRNAを含まない、検体あたり平均50Mリード以上をお届けします。
DRAGENを用いた2次解析は別途有償にて受けします(遺伝子発現量カウント表)
RNAseq解析 (kinnex法): お客様のTotal RNAを用いて、PacBio社のkinnexライブラリを調製します。8本の全長RNAを連結し、HiFi シーケンスを行います。RNAのisoform variant に着目した遺伝子発現解析が可能です。
検体あたり平均 5Mリード以上をお届けします。
エピゲノム解析: お客様のgDNAを用いて、アジレント社およびNEB社のMethyl-seqを行います。
リキッドバイオプシー解析: お客様のcell-free DNAを用いて、イルミナ社およびロシュ社のリキッドバイオプシーパネルを用いたライブラリ調製を行い、fastqデータをお届けします。
空間トランスクリプトーム解析: お客様の調製済ライブラリを用いて、MGI社のSTOmics (stereo-seq) 解析を行い、fastqデータをお届けします。2次解析には、検体あたり1300Mリード以上が必要です。
シングルセルRNAseq解析: お客様の調製済ライブラリを用いてシーケンス解析を行い、ご依頼に応じたデータ量のfastqデータをお届けします。
調製済みライブラリシーケンス解析: お客様の調製済ライブラリを用いて、フローセル占有もしくはレーン占有シーケンス解析を行い、fastqデータをお届けします。

最新カタログは、こちらからご覧いただくことができます。